Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms