Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms