Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms