Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SUSD4Q5VX71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms