Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BROXQ5VW32 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms