Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms