Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q5VSD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q5VSD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q5VSD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q5VSD8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms