Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCH4

CYP4A22, Cytochrome P450 4A22, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A22Q5TCH4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A22Q5TCH4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A22Q5TCH4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms