Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SNAPC4Q5SXM2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAPC4Q5SXM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNAPC4Q5SXM2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms