Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms