Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC158Q5M9N0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms