Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR38Q5JTN6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR38Q5JTN6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms