Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf116Q5BN46 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms