Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN4Q5BKX8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms