Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms