Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPRNQ4KMQ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms