Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRY2Q49AN0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms