Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTLL9Q3SXZ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms