Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms