Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms