Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms