Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RFX7Q2KHR2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms