Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms