Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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