Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTRK2Q16620 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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