Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ECM1Q16610 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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