Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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