Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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