Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITSN1Q15811 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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