Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTF1Q15361 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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