Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EXOSC7Q15024 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms