Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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