Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEPT6Q14141 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEPT6Q14141 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.8 ms