Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA3CQ13748 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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