Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH18Q13634 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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