Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDGQ13569 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDGQ13569 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDGQ13569 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDGQ13569 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDGQ13569 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDGQ13569 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDGQ13569 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDGQ13569 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDGQ13569 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDGQ13569 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms