Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAMK2DQ13557 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAMK2DQ13557 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms