Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PICALMQ13492 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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