Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XRCC4Q13426 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XRCC4Q13426 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XRCC4Q13426 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms