Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF1Q13351 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms