Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SP140Q13342 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SP140Q13342 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SP140Q13342 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP140Q13342 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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SP140Q13342 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SP140Q13342 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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