Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATMQ13315 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATMQ13315 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATMQ13315 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms