Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDZK1IP1Q13113 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDZK1IP1Q13113 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms