Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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