Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRDM2Q13029 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRDM2Q13029 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
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