Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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