Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAF2Q12933 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF2Q12933 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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