Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TROQ12816 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROQ12816 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TROQ12816 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TROQ12816 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TROQ12816 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TROQ12816 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TROQ12816 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TROQ12816 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TROQ12816 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TROQ12816 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TROQ12816 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TROQ12816 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms