Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFEMP1Q12805 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms