Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPQ12770 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAPQ12770 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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